Affaldsområdet er i dag opdelt på drift og myndighed således at Kerteminde Forsyning A/S er ansvarlig for driftsopgaverne og Kerteminde Kommune er myndighed.
Det betyder, at det i daglig drift er Kerteminde Forsyning A/S der varetager opgaver som fx indsamling af dagrenovation og drift af Genbrugsstationerne. Praktiske spørgsmål og henvendelser vedrørende bl.a. takster, tømningskalender og åbningstider på genbrugsstationerne skal derfor rettes til Kerteminde Forsyning A/S.
Kerteminde Kommune har som myndighed ansvaret for at anvise affald, udarbejde affaldsplaner og affaldsregulativer samt konkrete myndighedsopgaver på affaldsområdet: Disse er afgørelser i forhold til konkrete borgere og virksomheder. Det er eksempelvis løbende opgaver med at give godkendelser, tilladelser, dispensationer, føre tilsyn, kontrol, påbud og forbud.